热值是生物柴油应用于发动机的基本衡量指标，关系到发动机的动力性能。生物柴油的质量热值比矿物柴油低10％左右，但其密度高于矿物柴油，因此其体积热值仅低于矿物柴油3％～4％。而进入柴油机缸内的能量正是以燃油系统每个循环所供给的燃油体积热值来计算的。生物柴油直接应用于柴油机，在每个循环供油量不变的情况下，功率只比燃用柴油略低，而其含氧性却可以大幅降低黑烟排放。
八、碘值
油脂的碘值为每100克油脂吸收碘的克数。碘值的高低反映油脂的不饱和程度，碘值越高则不饱和程度越大。通过碘值的测定，可以计算出油脂中混合脂肪酸的平均双键数，而不饱和键的多少又与生物柴油的燃烧性能、运动黏度、冷滤点等有关，因此碘值可以在一定条件下判断生物柴油的性质。然而，低不饱和度的生物柴油，其碘值低，CN值高，但低温性能差，而高不饱和度的生物柴油，则碘值高，CN值低，但低温性能优异。这样，碘值、CN值和低温性能就存在相互矛盾的关系。目前已有研究，用基因工程技术可培育出CN值较高的油脂资源。
九、酯含量
生物柴油是由各种油脂经酯交换反应制备的脂肪酸甲酯，因而测定其甲酯含量及结构就可以确定生物柴油的纯度，这对于生物柴油的质量控制具有重要意义。
十、硫含量
硫含量对发动机尾气排放有很大影响，低硫燃料油对排放控制主要有两方面作用：直接减少颗粒和SO：排放；确保各类柴油汽车的颗粒物和NO排放控制的工作效能。
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